该剧讲述了小智(松本莉香 配音)来自真新镇,他的目标是要成为神奇宝贝顶级训练师。在即将展开训练师旅程的一天,因为迟到,他并没有拿到初始的小精灵。大木博士(石冢运昇 配音)见状,便送了一只不愿进精灵球和非常调皮的皮卡丘给这位失落的年轻人。于是,他们俩便踏上了精灵宝可梦的旅程。